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Facturation électronique E-commerce : ce qui change pour vous

Victoria Grimalid

Publié le 22 juin

par Victoria Grimaldi

5 min. de lecture

Victoria Grimalid

Publié par Victoria Grimaldi

Mis à jour le 24 juin

5 min

Vous gérez un commerce en ligne (dropshipping, marque online, artisanat…) ? Alors, vous devez vous tenir prêt·e car les e-commerces sont concernés par la réforme de la facturation électronique !

Qu’est-ce qui va vraiment changer pour vous en 2026 ? Quelles sont vos nouvelles obligations ? Nous vous dressons un récapitulatif complet (et digeste) de ce que vous devez savoir en tant qu’e-commerçant·e pour vous mettre en conformité.

Sommaire
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E-commerce : le résumé de vos obligations en matière de facture électronique

Facturation électronique : les obligations des e-commerces

Votre situation

Obligation

Vous achetez à des fournisseurs ou à d’autres entreprises en France

✅ Réception de factures électroniques

Vous vendez à des particuliers ou à une clientèle étrangère

✅ E-reporting
❌ Pas d’émission de factures électroniques

Vous vendez à des entreprises

✅ Émission de factures électroniques

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Êtes-vous concerné·e par la réforme de la facturation électronique ?

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Facturation électronique pour les boutiques en ligne : la réforme en bref

La réforme de la facturation électronique vise à obliger les entreprises à échanger des factures par voie dématérialisée. Le but de la réforme est clair : lutter contre la fraude à la TVA et simplifier les échanges entre entreprises.

Les entreprises devront utiliser un intermédiaire pour envoyer ces “e-factures” : une plateforme agréée (PA) immatriculée par l’État. Ces factures électroniques transiteront ensuite via les PA dans l’un des 3 formats structurés suivants : Factur-X, UBL ou CII.

👉 Cette réforme comporte 3 obligations distinctes (mais toutes ne vous concernent pas !) : 

  1. La réception des factures électroniques qui s’applique à toutes les entreprises.

  2. L’émission de factures électroniques qui ne vous concerne pas si vous vendez à des particuliers (B2C) mais sera obligatoire si vous vendez à des entreprises en France (B2B).

  3. L’e-reporting, c’est-à-dire la transmission des données à l'administration fiscale, qui vise les ventes aux particuliers et à une clientèle étrangère.

Le calendrier d’application de la facturation électronique pour les e-commerces

Voici les dates d’entrée en vigueur de la facturation électronique à retenir pour votre boutique en ligne : 

Calendrier de la facturation électronique

Date

Obligation

Qui est concerné·e ?

1er septembre 2026

Réception de factures électroniques

Tous les e-commerçant·es, sans exception

1er septembre 2026

Émission de factures électroniques

Grandes entreprises et ETI

1er septembre 2027

Émission de factures électroniques

TPE, PME, auto-entrepreneures

1er septembre 2027

E-reporting

TPE, PME, auto-entrepreneures

Pour les factures fournisseurs et prestataires : obligation de réception

La toute première obligation et la plus urgente à mettre en place est celle-ci : vous devez être en capacité de recevoir des factures électroniques. Cette obligation concerne les factures que vous recevez d’entreprises implantées en France.

👉 Elle s’applique à toutes les entreprises.

Attention : si vous travaillez avec des fournisseurs étrangers, ces derniers ne sont pas soumis à cette obligation. Vous n’avez donc pas de factures électroniques de leur part à réceptionner.

📌 Quelques exemples concrets de factures possibles : 

  • vos fournisseurs si vous faites de l’achat-revente ou si vous achetez de la matière première pour fabriquer des objets ;

  • votre abonnement à votre CMS (WooCommerce, Shopify, etc.) ;

  • votre hébergeur web ;

  • des outils ;

  • vos prestataires si vous sous-traitez (par exemple : la rédaction d’articles de blog pour vous faire connaître, des Ads…), etc.

Toutes ces factures devront être des factures électroniques qui transiteront par le biais d’une plateforme agréée dès le 1er septembre 2026.

💍 Exemple

Camille crée et vend des bijoux artisanaux sur sa boutique WooCommerce. Elle ne facture que des particuliers. Mais son fournisseur de chaînes en argent et la société d'hébergement web pour son site sont des grandes entreprises ! Elle devra donc choisir une plateforme agréée pour réceptionner leurs factures, même si son activité est 100 % B2C.

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Pour les particuliers et la clientèle étrangère : e-reporting obligatoire

Pour toutes les ventes que vous réalisez avec des particuliers ou une clientèle étrangère, il n’y a aucune obligation d’émettre des factures électroniques.

C’est plutôt une bonne nouvelle pour vous au vu du nombre de factures que vous traitez !

Vous pouvez donc continuer à envoyer des factures classiques par mail en PDF plutôt que des factures électroniques si vous le souhaitez.

Mais attention : ces transactions n’ont cependant pas vocation à passer sous les radars de l’administration fiscale ! Vous devrez remplir une autre obligation : l’e-reporting.

Il s’agit d’un résumé de vos ventes qui doit être transmis régulièrement à l'administration fiscale (tous les 10 jours, tous les mois ou tous les 2 mois en fonction de votre régime fiscal).

Ce fichier récapitulatif reprend des données comme le montant HT, la TVA collectée ou encore la nature des produits vendus.

👉 Avec un outil de facturation compatible, l'e-reporting peut être facilement automatisé.

👟 Exemple

Karim réalise 300 ventes par mois sur son e-commerce de sport outdoor avec une clientèle constituée à 30 % d’étrangers. Il n'a pas à envoyer 300 factures électroniques à l'administration mais seulement à transmettre un résumé de ses ventes via sa plateforme agréée. Ses client·es continueront à recevoir leur confirmation de commande par e-mail, comme avant.

Pour votre clientèle professionnelle : obligation d’émission

Cette obligation est sans doute plus résiduelle pour un e-commerce mais elle peut exister en fonction de la nature de votre business. 

Elle ne vous concerne que si vous vendez vos biens à des professionnel·les (B2B). Dans ce cas, vous devrez envoyer une facture électronique via une plateforme agréée.

Il ne faudra pas oublier de faire figurer le numéro de SIREN du professionnel·le sur cette facture.

🖥️ Exemple

Thomas vend du matériel informatique sur sa boutique en ligne. 80 % de ses client·es sont des particuliers. Mais il facture aussi 20 % d'entreprises qui lui achètent du matériel pro. Pour ces dernières, Thomas devra émettre des factures électroniques via sa plateforme agréée.

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Votre boutique en ligne est-elle prête pour la facturation électronique ?

L’échéance approchant, il est grand temps de vous préparer à émettre et recevoir des factures électroniques ! Voici 3 étapes à suivre.

1. Vérifier la compatibilité de vos outils

Que vous utilisiez WooCommerce, PrestaShop, Magento ou Shopify, pas de panique : les grandes plateformes e-commerce travaillent à leur compatibilité avec la réforme.

Néanmoins, la plupart de ces plateformes ne vont pas générer de factures électroniques conformes directement. Pour cela, vous devez compter sur votre logiciel de facturation qui doit être connecté à une PA ou être PA lui-même.

👉 Votre outil de facturation doit être capable : 

  • d’intégrer vos factures depuis les marketplaces et les CMS e-commerce ;

  • d’envoyer des factures conformes à chaque typologie de client·e (exemple : Factur-X pour votre clientèle B2B et factures PDF par mail à votre clientèle B2C) ; 

  • de récupérer les données nécessaires à l’e-reporting et les agréger.

🛍️ Les ventes réalisées sur une marketplace

Vous vendez sur une marketplace (Etsy, Vinted ou Amazon) ? Ces ventes n'échappent pas au e-reporting. C’est à vous de gérer cette obligation, et non à la plateforme.

2. Choisir votre plateforme agréée (PA)

Une plateforme agréée (PA) est nécessaire pour envoyer et recevoir vos factures électroniques. Elle est aussi indispensable pour gérer l’e-reporting.

En clair, sans PA, vous ne pourrez pas remplir vos obligations !

Il existe actuellement une centaine de plateformes immatriculées. Pour choisir votre PA, vous pouvez consulter la liste des plateformes disponibles sur impots.gouv.

✨ Shine est PA

Shine vous accompagne avant, pendant et après la réforme. Nous sommes plateforme agréée par l’État : vous émettez vos factures comme d'habitude et nous gérons la conformité !

3. Profiter des avantages de la facturation électronique pour vos ventes en ligne

La réforme n'est pas qu'une contrainte. En vous mettant en conformité, vous bénéficiez aussi des avantages concrets de l’e-facturation :

Moins d'erreurs dans les factures : les données sont transmises automatiquement, sans ressaisie manuelle qui peut conduire à des erreurs.

Paiements plus rapides : la traçabilité des factures facilite les relances et réduit les délais de paiement.

Moins de paperasse : vos déclarations de TVA seront pré-remplies à terme grâce aux données transmises.

Gain de temps : une fois les process maîtrisés et intégrés, vous pourrez gagner du temps (pré-remplissage des déclarations de TVA, saisie automatique, etc.).

À retenir sur la facturation électronique des e-commerces

Dès le 1er septembre 2026, toutes les boutiques en ligne doivent être capables de réceptionner des factures électroniques de leurs fournisseurs via une plateforme agréée.

Si vous vendez à des particuliers, votre principale obligation sera l'e-reporting : transmettre périodiquement un résumé de vos ventes à l'administration (à partir de septembre 2027 pour les TPE et PME).

Vous n’aurez pas besoin d’envoyer des e-factures à chaque client·e. Le seul cas où vous devrez le faire : si vos client·es sont des entreprises.

Après tout ça, vous vous demandez si vous devez changer d’outil de facturation ? Vous pouvez lire notre article pour le savoir !

Shine propose un outil de facturation intégré à votre compte pro qui vous permettra d’envoyer et de recevoir des factures électroniques gratuitement 🙌.

Questions fréquentes

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